Nazwisko pochodzi od przezwiska Wydra, to zaś od wydra: 1. brodawka na twarzy, 2. zwierzę ssące drapieżne z nogami płetwowatemi, 3. wydry = futro z wydr (zob. tzw. Słownik warszawski, t. VII, s. 844). Podstawę nazwiska mogła też stanowić nazwa miejscowa Wydra, odnotowana na terenie byłych powiatów: gostyńskiego, częstochowskiego, piotrkowskiego, mohylowskiego, olhopolskiego, żytomierskiego, porzeckiego, sokalskiego, podhajeckiego (zob. „Słownik geograficzny Królestwa Polskiego i innych krajów słowiańskich, t. X, s. 78). Taką nazwę osobową odnotowano na terenie Polski już w 1477 roku (zob. Nazwiska Polaków. Słownik historyczno-etymologiczny, t. II L-Ż, Kraków 2001, s. 708). Nazwisko przytacza J. Bubak, (Słownik nazw osobowych i elementów identyfikacyjnych Sądecczyzny, cz. II, Kraków 1992, s. 294): Georgius Vidra 1481, Martinus dictus Wydra de Crac. 1499, Martini Wydra de Crac. 1501, Stanislawa syna Mikolaya Wydry obyw. Miasta Nowego Brzeska 1613, sławnymi P. Woyciechem Wydrą miescz. sądeczkim 1650, Czecha Srotowa ucciwemu Woyciechowi Widrze starszemu Czechmistrzow w Piewowarskiem czechu 1656.
