Nazwisko utworzono przyrostkiem –ski od jednej z nazw miejscowych: Szczepki (w byłym powiecie augustowskim), Szczepkowice (w byłym powiecie słupskim), Szczepkowo (w byłych powiatach: sierpeckim, mławskim, suskim) (zob. Słownik geograficzny Królestwa Polskiego i innych krajów słowiańskich, t. XI, s. 846). Por. też szczep: 1. szczepienie, krzewienie, 2. latorośl do szczepienia drzewa, 3. drzewko po szczepieniu, 4. pień, ród, dynastia, 5. przenośnie praojciec, protoplasta oraz szczepać: 1. łupać, płatać, rozrąbywać, 2. szczypać, skubać (zob. tzw. Słownik warszawski, t. VI, s. 582).
